王峥峰 分子生态学
 

软件更新

1.  第六章,Structure结果分析中,书中提过用CLUMPP这个软件,现在也可用CLUMPAK这个软件,它包含了CLUMPP分析,有新扩展。软件下载地址请见http://clumpak.tau.ac.il/index.html。其中新的扩展是:对于有些种群,其分组界限不很明朗。在某些情况下它可能和某些种群分为一组,在另一情况下会和另外的种群分为一组,不确定。分析时我们可以把这两种情况同时讨论。下面附一副图进行说明(请见下图)

  这是我们对海南苏铁进行的研究。我在进行Structure分析中,发现ZBL种群的分组不是很确定。在20次分析中,有7次和BLLC种群分为一组,有13次不和BLLC种群分为一组。我就把这两种情况分别画出了。但这个分析很早做的,没有用CLUMPAK软件,分组差异的结果不是自动发现的。现在有了CLUMPAK软件,可以自动进行分析了。