王峥峰 分子生态学

 
《分子生态学与数据分析基础》已出版。相关网站有售
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本书首先从理论上介绍了分子生态学基本研究内容和手段,并总结作者以往的研究工作,较全面的概括了分子生态学理论内涵,使读者对分子生态学具有深刻认识;再从实践角度介绍了分子生态学数据获得的方法与具体分析内容和步骤,特别是采用图解法一步一步对分子生态学用到的各种主流分析软件进行过程讲解(包括作者编写的程序),不但有各类分析提示,还提供演示数据和程序,可谓全面到位,非常有利于读者学习参考,加深对分子生态的认识。因此,本书具有极强的理论性和实践操作性,对于促进我国分子生态学发展、利用分子遗传标记手段进行物种经营、保护,资源利用和环境规划具有重要的推动作用。

本书不但适用高等学校、研究机构从事分子生态学和相关领域研究的师生,也适用于农、林、牧、副、渔、医各行业利用分子遗传标记开展研究和工作的人员。





培训消息

    随着高通量测序技术的日益普及,如何快速掌握和处理高通量测序数据成为分子生态学初学者面临的难题,特别是对没有接触过linux系统的同学和老师。为此,我开办高通量测序数据分析培训班,旨在通过实例分析,一步一步讲解和手把手指导教会初学者高通量测序数据分析的原理和数据处理流程。目前这一培训班以分子生态学分子标记snp和indel为重点,使学员掌握:

      1)如何安装linux系统?安装哪种linux使得装完后的系统包含各类基础程序(如编译系统、数据、文本处理工具等),免去安装初始程序烦恼;

     2)如何安装特定软件?选择哪些软件使得数据分析又快又高效?包括数据质量分析、原始数据处理整理、序列组装(不同数据类型组装策略是什么,用什么不同方法组装)、...、获得特定序列、批量自动提取特定序列和设计引物、大量个体的snp数据获得并转换为各种特定数据格式;

     3)如何自己编写程序批量处理大量数据(如成百上千个个体)?

     4)其它。如何赋予linux更多功能?为什么按照程序操作,却报错,哪里有问题呢?...

    通过这个培训,学员对任何其它类型高通量数据处理都不会感到困难了。有助于写论文、找工作。

     培训班报名费3000元/人(有发票报销),每班最多6人(太多无法一一指导和解答)。

     请自带电脑,纪录本等。可自带数据尝试分析。由于需要安装linux系统,不是用的虚拟机(有些程序在虚拟机无法运行),如来培训,请做好电脑内的数据备份,安装linux过程会覆盖掉部分原始数据。

      培训时间2-3天,视培训人员的掌握速度。培训地点在广州,我实验室。有单位宾馆(每天120元),学生食堂。如感兴趣,请发电子邮件给我,wzf@scib.ac.cn或wzf1973@21cn.com。


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个人简介

一、基本信息

姓名:   王峥峰          

研究方向: 分子生态学、群落生态学

职称:   研究员  博士生导师


二、教育背景

1991.91995.7  

南京大学生物科学与技术系,获理学学士学位

1995.91997.7

南京大学生物科学与技术系,获生态学硕士学位

1997.92000.7  

中山大学生命科学院,获植物学博士学位


三、工作经历

2000.82002.6  

中国科学院华南植物园(原中国科学院华南植物研究所),助理研究员

2002.72004.8  

中国科学院华南植物园,副研究员

2004.9 -至今    

中国科学院华南植物园,研究员。2008年获博士生导师资格


四、留学经历

2002.42002.10  

美国乔治亚大学(The University of Georgia)访问学者。

2006.102006.12  

瑞典于默奥大学(the University of Umeå)访问学者。


五、研究兴趣

    1物种更新、扩散、适应进化的分子生态学研究。

    2环境生物的分子标记研究。


六、获奖状况

    1.   2005年研究成果“全球变化与农业生态系统相互作用研究”获广东省科学技术奖一等奖(排名第9)。广东省人民政府

    2.   2012年研究成果“华南珍稀濒危植物的野外回归研究与应用”获广东省环境保护科学技术奖一等奖(排名第10。广东省环境保护厅

    3.   2013年研究成果华南珍稀濒危植物的野外回归研究与应用获广东省科学技术一等奖(排名第10。广东省人民政府

  

七、发表的部分文章

Wang ZF, Lian JY, Ye WH, Cao HL, Zhang QM, Wang ZM. Pollen and seed flow under different predominant winds in wind-pollinated and wind-dispersed species Engelhardia roxburghiana. Tree genetics & Genome, 2016, 12: 19

Wang ZF, Zhang M, Jian SG. The Limitation of Genetic Diversity Conservation in Botanical Gardens: A Case Study of Endangered Species Cycas hainanensis. pp. 85-102. In: Melinda Quinn (ed.) Endangered Species: Threats, Conservation and Future Research. Nova publication. 2016

Wang ZF, Lian JY, Ye WH, Cao HL, Wang ZM. The spatial genetic pattern of Castanopsis chinensis in a large forest plot with complex topography. Forest Ecology and Management, 2014, 318: 318-325  

Wang ZF, Ren H, Li ZC,Zhang QM, Liang KM, Ye WH, Wang ZM. Local genetic structure in the critically endangered, cave-associated perennial herb Primulina tabacum (Gesneriaceae). Biological Journal of the Linnean Society, 2013, 109: 747-756

Wang ZF, Lian JY, HuangGM, Ye WH, Cao HL,Wang ZM. Genetic groups in the common plant species Castanopsis chinensis and their associations with topographic habitats. Oikos, 2012, 121: 2044-2051

Wang ZF , Ren H, Zhang QM, Ye WH, Liang KM, Li ZC. Isolation and characterization of microsatellite markers for Primulina tabacum, acritically endangered perennial herb. Conservation Genetics, 2009, 10: 1433-1435

Wang ZF, Zhu P, Ye WH. Development and characterization of 13 microsatellite markers for Cryptocarya concinnain lower subtropical China.Conservation Genetics, 2009, 10: 1841-1843

Wang ZF, Ye WH, Cao HL, Li ZC, Peng S L. Identification and characterization of EST-SSRs and cpSSRs in endangered Cycas hainanensis. Conservation Genetics, 2008, 9: 1079-1081

Wang ZF, Ye WH, Fu SL, Ren H, Peng SL.Microsatellites reveal unexpected clonal growth and genetically distinct groups in Cryptocarya chinensis in fragmented lower subtropical forest,China. Silvae Genetica, 2008, 57: 324-332

Wang ZF, Li G, Fu SL, Ren H. Isolation and characterization of microsatellite loci in Cryptocarya chinensis in lower subtropical China. Conservation Genetics, 2007, 8: 1235-1237

Wang ZF, Hamrick JL, Godt MJW. High genetic diversity in Sarracenia leucophylla (Sarraceniaceae), a carnivorous wetland herb. Journal of Heredity, 2004, 95: 234-243

Wang ZF, Peng SL, Liu SZ, Li Z. Spatial pattern of Cryptocarya chinensis life stages in lower subtropical forest, China.Botanical Bulletin of Academia Sinica, 2003, 44: 159-166

Chen WS, Zhao G, Jian SG (Correspondingauthor), Wang ZF(Corresponding author). Development of microsatellite markers for Suriana maritima (Surianaceae) using next-generation sequencing technology. Genetics and Molecular Research, 2015,14(4): 14115-14118

Wang F,Wang ZF(Corresponding author), Ye WH, Liang Y, Ma KP(Corresponding author). Isolation and characterization of microsatellite loci inanendemic species Styrax odoratissimus (Styracaceae) in subtropical forests. Conservation Genetic Resources, 2014, 6:579-580

Zhang DD, Luo P, Chen Y, Wang ZF(Corresponding author), Ye WH, Cao HL. Isolation and characterizationof 12 polymorphic microsatellite markers in Engelhardia roxburghiana (Juglandaceae). Silvae Genetica, 2014, 63(3):109-112

He J, Li X Y, Gao DD, Zhu P, Wang ZF(Corresponding author), Wang ZM, Ye WH, Cao HL. Topographic effects on fine-scale spatial genetic structure in Castanopsis chinensis Hance (Fagaceae). Plant Species Biology, 2013, 28: 87-93

Zhu P, Wang ZF(Correspondingauthor),Ye WH, Cao HL. Maintenance of genetic diversity in a small, isolated population of ancient tree Erythrophleum fordii. Journal of Systematics and Evolution, 2013, 51: 722-730

Niu HY, Ye WH, Wang ZF(Correspondingauthor), Chen Y, Cao HL,Wu LF, Wang ZM. Development and characterization of 16 new polymorphic microsatellite loci for Schima superba (Theaceae). Silvae Genetica, 2013,62: 124-127

Niu HY, Li XY, Ye WH, Wang ZF(Corresponding author), Cao HL(Correspondingauthor), Wang ZM. Isolation and characterization of 36 polymorphic microsatellite markers in Schima superba (Theaceae). American Journal of Botany, 2012:e123-e126

Dong L, Wang ZF(Corresponding author), Zhu P, Ye WH. Isolation and characterization of microsatellite loci in Castanopsis fissa in lower subtropical China. Silvae Genetica, 2010, 59: 299-300

Zhu P, Ye WH, WangZF(Corresponding author), Cao HL,Zhang M, Li L, Xiao W. Isolation and characterization of ten polymorphic microsatellite in the endangered tree Erythrophleum fordii oliv. Conservation Genetics, 2009, 10:1017-1019

Zhang M, Wang ZF(Corresponding author), Jian SG, Ye WH, Cao HL,Zhu P, Li L. Isolation and characterization of microsatellite markers for Cycas hainanensis C. J. Chen. Conservation Genetics.2009, 10: 1175-1176

Li L, Wang ZF(Corresponding author), Jian SG(Corresponding author), Zhu P, ZhangM, Ye WH, Ren H. Isolation and characterization of microsatellite loci inendangered Cycas changjiangensis (Cycadaceae). Conservation Genetics, 2009, 10: 793-795

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